Pengajian kitab di Pondok Pesantren Darussalam awalnya bersifat Halaqah dan kini berganti menjadi sistem klasikal atau berkelas-kelas sesuai tingkatannya. Dalam pendidikan di SMP, pengajian kitab terbagi menjaid tiga marhalah yang lama satu tahun ajarannya sama dengan satu tahun ajaran di SMP, berikut ini adalah daftar kitab-kitab yang diajarkan:
MARHALAH ULA
- Aqidatul Awam (Tauhid)
- Safinatunnaja (Fiqih)
- Hidayatus Shibyan (Tajwid)
- Hadits Arba’in Nawawi (Hadits)
- Ta’limul Muta’allim (Adab)
- Matn Ajurumiyah (Nahwu)
- Amtsilah Tashrifiyah (Sharaf)
- Khulasoh Nurul Yaqin (Sirah Nabawiyah)
- Al ‘Arabiyah Baina Yadaik I (Bahasa Arab)
MARHALAH TSANIYAH
- Taqrib (Fiqih)
- Nadzam ‘Imrithy (Nahwu)
- Nadzam Maqshud (Sharaf)
- Nadzam Baiquniyah (Mustholah Hadits)
- Matan Sanusiyah (Tauhid)
- Durus Tarikh Islamy I (Tarikh)
- Hujjah Ahlus Sunnah Wal Jama’ah (Dalil Amalan Aswaja)
- Al ‘Arabiyah Baina Yadaik II (Bahasa arab)
MARHALAH TSALISAH
- Tahqiq Taqrib (Fiqih)
- Mutammimah (Nahwu)
- Syadzul ‘Urf (Sharaf)
- Waraqat (Ushul Fiqh)
- Umdatul Ahkam (Hadits Ahkam)
- ‘Idatul Faridh (Faraidh / Mawarits)
- Tafsir Jalalain (Juz ‘Amma) (Tafsir)
- Durus Tarikh Islamy II (Tarikh)
- Al ‘Arabiyah Baina Yadaik III (Bahasa Arab)
